抗菌藥物耐藥性病原體（例如耐碳青霉烯類腸桿菌和耳念珠菌）的增加帶來了重大挑戰(zhàn)。多重耐藥性病原體在醫(yī)療環(huán)境中越來越普遍，而新冠疫情加劇了這一問題，因?yàn)橐咔橐环矫娼o感染控制措施帶來壓力，另一方面導(dǎo)致抗生素的濫用增加。
檢測和追蹤這些病原體需要使用先進(jìn)的分子檢測方法，但這些方法在全球范圍內(nèi)并非普遍存在。
在歐盟，抗菌藥物耐藥性（AMR）每年導(dǎo)致約250萬額外的住院天數(shù)，造成大約15億歐元的額外醫(yī)療成本及生產(chǎn)力損失。
與醫(yī)療相關(guān)感染相關(guān)的細(xì)菌中，大約有三分之一對抗生素具有耐藥性。這種高耐藥性率導(dǎo)致患者住院時間延長及死亡率上升。
某些群體，如接受癌癥治療的患者、免疫系統(tǒng)較弱的人群、透析患者以及接受復(fù)雜手術(shù)的患者，更容易感染耐藥菌。
下一代測序（NGS）技術(shù)在傳染病檢測中的應(yīng)用對于抗菌藥物耐藥性（AMR）管理至關(guān)重要，因?yàn)樗軌蚩焖勹b定耐藥基因，為臨床抗菌藥物選擇提供分子生物學(xué)依據(jù)。
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